MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLb

Total Repeats: 3151

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_002682	TTG	2	6	107363	107368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488482
1502	NC_002682	CG	4	8	107369	107376	0 %	0 %	50 %	50 %	13488482
1503	NC_002682	GC	3	6	107378	107383	0 %	0 %	50 %	50 %	13488482
1504	NC_002682	CGG	2	6	107433	107438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488482
1505	NC_002682	TGA	2	6	107652	107657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488482
1506	NC_002682	GGC	2	6	107668	107673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488482
1507	NC_002682	CCT	2	6	107709	107714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488482
1508	NC_002682	CGG	2	6	107742	107747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488482
1509	NC_002682	CCT	2	6	107751	107756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488482
1510	NC_002682	TCG	2	6	107825	107830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488482
1511	NC_002682	CGG	2	6	107835	107840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488482
1512	NC_002682	GC	3	6	107906	107911	0 %	0 %	50 %	50 %	13488482
1513	NC_002682	GCG	2	6	107925	107930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488482
1514	NC_002682	GC	3	6	107994	107999	0 %	0 %	50 %	50 %	13488482
1515	NC_002682	GCA	2	6	108027	108032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488482
1516	NC_002682	TTC	2	6	108052	108057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488482
1517	NC_002682	TTG	2	6	108122	108127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488482
1518	NC_002682	TGC	2	6	108137	108142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488482
1519	NC_002682	ACG	2	6	108167	108172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488482
1520	NC_002682	CAG	2	6	108238	108243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488482
1521	NC_002682	GCA	2	6	108249	108254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488482
1522	NC_002682	CGA	2	6	108279	108284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488482
1523	NC_002682	CGT	2	6	108301	108306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488482
1524	NC_002682	GCC	2	6	108316	108321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488482
1525	NC_002682	GAC	2	6	108475	108480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488482
1526	NC_002682	GCC	2	6	108524	108529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488482
1527	NC_002682	GGC	3	9	108552	108560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488482
1528	NC_002682	CAG	2	6	108583	108588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488482
1529	NC_002682	GCG	2	6	108621	108626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488482
1530	NC_002682	GCT	2	6	108678	108683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488482
1531	NC_002682	CTT	2	6	108691	108696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488482
1532	NC_002682	GCGA	2	8	108707	108714	25 %	0 %	50 %	25 %	13488482
1533	NC_002682	GCC	3	9	108721	108729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488482
1534	NC_002682	CTC	2	6	108763	108768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488482
1535	NC_002682	AGG	2	6	108843	108848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488482
1536	NC_002682	TGAT	2	8	109063	109070	25 %	50 %	25 %	0 %	13488482
1537	NC_002682	ATG	2	6	109079	109084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488482
1538	NC_002682	ATG	2	6	109999	110004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488483
1539	NC_002682	GGCC	2	8	110014	110021	0 %	0 %	50 %	50 %	13488483
1540	NC_002682	GCCT	2	8	110062	110069	0 %	25 %	25 %	50 %	13488483
1541	NC_002682	GTC	2	6	110079	110084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488483
1542	NC_002682	GGC	2	6	110103	110108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488483
1543	NC_002682	CAT	2	6	110178	110183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488483
1544	NC_002682	T	6	6	111412	111417	0 %	100 %	0 %	0 %	13488484
1545	NC_002682	CTG	2	6	111442	111447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488484
1546	NC_002682	GGC	4	12	111465	111476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488484
1547	NC_002682	CGC	2	6	111525	111530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488484
1548	NC_002682	CGG	2	6	111618	111623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488484
1549	NC_002682	GGC	3	9	111625	111633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488484
1550	NC_002682	CCTTGC	2	12	111645	111656	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	13488484
1551	NC_002682	GGT	2	6	111801	111806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488484
1552	NC_002682	CCA	2	6	111908	111913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488484
1553	NC_002682	TCGA	2	8	111922	111929	25 %	25 %	25 %	25 %	13488484
1554	NC_002682	CGG	2	6	111972	111977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488484
1555	NC_002682	TGG	2	6	111988	111993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488484
1556	NC_002682	CAT	2	6	112086	112091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488484
1557	NC_002682	TTG	2	6	112130	112135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488484
1558	NC_002682	GAA	2	6	112180	112185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488484
1559	NC_002682	ATC	2	6	112204	112209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488484
1560	NC_002682	CG	4	8	112212	112219	0 %	0 %	50 %	50 %	13488484
1561	NC_002682	GCA	2	6	112255	112260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488484
1562	NC_002682	ACA	2	6	112292	112297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488484
1563	NC_002682	TTGG	2	8	112312	112319	0 %	50 %	50 %	0 %	13488484
1564	NC_002682	AGG	2	6	112328	112333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488484
1565	NC_002682	CG	3	6	112336	112341	0 %	0 %	50 %	50 %	13488484
1566	NC_002682	GCTG	2	8	112773	112780	0 %	25 %	50 %	25 %	13488485
1567	NC_002682	TAC	2	6	112888	112893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488485
1568	NC_002682	CT	3	6	112932	112937	0 %	50 %	0 %	50 %	13488485
1569	NC_002682	TCG	2	6	112961	112966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488485
1570	NC_002682	GGT	2	6	113040	113045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488485
1571	NC_002682	GCC	2	6	113179	113184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488485
1572	NC_002682	CGC	2	6	113185	113190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488485
1573	NC_002682	TCGGT	2	10	113208	113217	0 %	40 %	40 %	20 %	13488485
1574	NC_002682	ACA	2	6	113231	113236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488485
1575	NC_002682	AGC	2	6	113318	113323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488485
1576	NC_002682	CCG	2	6	113327	113332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488485
1577	NC_002682	GCC	2	6	113380	113385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488485
1578	NC_002682	GTA	2	6	113886	113891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488486
1579	NC_002682	ATT	2	6	114003	114008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13488486
1580	NC_002682	ATT	2	6	114042	114047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13488486
1581	NC_002682	T	6	6	114145	114150	0 %	100 %	0 %	0 %	13488486
1582	NC_002682	TGC	2	6	114165	114170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488486
1583	NC_002682	GCC	2	6	114410	114415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488486
1584	NC_002682	AGC	2	6	114436	114441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488486
1585	NC_002682	GCC	2	6	114468	114473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488486
1586	NC_002682	TGACC	2	10	114735	114744	20 %	20 %	20 %	40 %	13488487
1587	NC_002682	CAA	2	6	114780	114785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488487
1588	NC_002682	GAG	2	6	114791	114796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488487
1589	NC_002682	CG	3	6	114800	114805	0 %	0 %	50 %	50 %	13488487
1590	NC_002682	CGG	2	6	114814	114819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488487
1591	NC_002682	TCT	2	6	114833	114838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488487
1592	NC_002682	TGC	2	6	114842	114847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488487
1593	NC_002682	CAC	2	6	114894	114899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488487
1594	NC_002682	GT	3	6	114935	114940	0 %	50 %	50 %	0 %	13488487
1595	NC_002682	ATG	2	6	114974	114979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488487
1596	NC_002682	GAT	2	6	114990	114995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488487
1597	NC_002682	TCCG	2	8	115006	115013	0 %	25 %	25 %	50 %	13488487
1598	NC_002682	CAG	2	6	115021	115026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488487
1599	NC_002682	A	6	6	115038	115043	100 %	0 %	0 %	0 %	13488487
1600	NC_002682	CG	3	6	115072	115077	0 %	0 %	50 %	50 %	13488487
1601	NC_002682	TGC	2	6	115180	115185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488488
1602	NC_002682	CAG	2	6	115260	115265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488488
1603	NC_002682	CTT	2	6	115361	115366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488488
1604	NC_002682	CCG	2	6	115385	115390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488488
1605	NC_002682	CCA	2	6	115417	115422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488488
1606	NC_002682	GC	3	6	115466	115471	0 %	0 %	50 %	50 %	13488488
1607	NC_002682	AGG	2	6	115674	115679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488489
1608	NC_002682	CAG	3	9	115790	115798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488489
1609	NC_002682	ATG	2	6	115850	115855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488489
1610	NC_002682	GAT	2	6	115861	115866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488489
1611	NC_002682	ATG	2	6	115874	115879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488489
1612	NC_002682	GCG	3	9	115923	115931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488489
1613	NC_002682	GCA	2	6	115974	115979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488489
1614	NC_002682	GAT	2	6	116011	116016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488489
1615	NC_002682	ATG	2	6	116036	116041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488489
1616	NC_002682	ATGGCG	2	12	116061	116072	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	13488489
1617	NC_002682	TTGG	2	8	116099	116106	0 %	50 %	50 %	0 %	13488489
1618	NC_002682	ACA	2	6	116127	116132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488489
1619	NC_002682	GAA	2	6	116156	116161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488489
1620	NC_002682	TTC	2	6	116171	116176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488489
1621	NC_002682	AAT	2	6	116202	116207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13488489
1622	NC_002682	GTT	2	6	116867	116872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488490
1623	NC_002682	ATG	2	6	116908	116913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488490
1624	NC_002682	AGCA	2	8	116919	116926	50 %	0 %	25 %	25 %	13488490
1625	NC_002682	CAG	2	6	116940	116945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488490
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1732	NC_002682	GATC	2	8	121614	121621	25 %	25 %	25 %	25 %	13488494
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1746	NC_002682	TGC	2	6	122774	122779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488496
1747	NC_002682	CCCG	2	8	122900	122907	0 %	0 %	25 %	75 %	13488496
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1751	NC_002682	CCG	2	6	123093	123098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488496
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1863	NC_002682	GTAG	2	8	130313	130320	25 %	25 %	50 %	0 %	13488502
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1866	NC_002682	CGT	2	6	130451	130456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488502
1867	NC_002682	AT	3	6	130471	130476	50 %	50 %	0 %	0 %	13488502
1868	NC_002682	ACG	2	6	130525	130530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488502
1869	NC_002682	ATC	2	6	130545	130550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488502
1870	NC_002682	CTC	2	6	130554	130559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488502
1871	NC_002682	GGC	2	6	130593	130598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488502
1872	NC_002682	CGA	2	6	130617	130622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488502
1873	NC_002682	GGC	2	6	131247	131252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488503
1874	NC_002682	CTG	2	6	131253	131258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488503
1875	NC_002682	CGCC	2	8	131279	131286	0 %	0 %	25 %	75 %	13488503
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1882	NC_002682	GCC	2	6	131542	131547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488503
1883	NC_002682	CTT	2	6	131567	131572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488503
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1885	NC_002682	CTG	2	6	131631	131636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488503
1886	NC_002682	GTC	2	6	131637	131642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488503
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1888	NC_002682	TAG	2	6	131692	131697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488503
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1892	NC_002682	TGCG	2	8	132226	132233	0 %	25 %	50 %	25 %	13488504
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1948	NC_002682	ACG	2	6	136486	136491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488510
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1975	NC_002682	ATC	2	6	138346	138351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488513
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1989	NC_002682	CAGCG	2	10	139802	139811	20 %	0 %	40 %	40 %	13488515
1990	NC_002682	ATC	2	6	139830	139835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488515
1991	NC_002682	CTG	3	9	140014	140022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488516
1992	NC_002682	CGC	2	6	140046	140051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488516
1993	NC_002682	GGC	2	6	140061	140066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488516
1994	NC_002682	TAT	2	6	140098	140103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13488516
1995	NC_002682	ACG	2	6	140111	140116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488516
1996	NC_002682	GCTT	2	8	140129	140136	0 %	50 %	25 %	25 %	13488516
1997	NC_002682	GGC	2	6	140154	140159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488516
1998	NC_002682	TGC	2	6	140183	140188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488516
1999	NC_002682	CGA	2	6	140190	140195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488516
2000	NC_002682	AAC	2	6	140236	140241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488516

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